如果未成年男方否认强奸指控，法律会根据双方提供的证据和陈述进行判断。在《刑法》第二百三十六条强奸罪的规定下，法院会详细审查案件事实，包括双方年龄、是否发生性行为、是否违背女方意志等。若证据显示未成年男方确实使用了暴力、猥亵等手段或故意与不满十四周岁的幼女发生性关系，即便男方否认，也可能被判定犯有强奸罪。
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未成年被女方告强奸，法律处理因年龄阶段而异：若未成年男方已满十四周岁但未满十六周岁，犯强奸罪应负刑事责任，但会从轻或减轻处罚；若未满十四周岁，则不负刑事责任，但可能需接受其他教育矫治措施。具体处理需结合案件具体情况和法律规定。
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从法律角度，未成年男方应：1. 保持冷静，配合调查；2. 寻求专业律师帮助，了解自身权益；3. 准备相关证据，如通讯记录、证人证言等，以证明自身清白；4. 若被采取强制措施，应依法行使申诉、辩护等权利。